Tiago,
>>crio novas coisas no projecto activando o check out e depois check in
Quando você cria algo novo no projeto não pode fazer check out, porque só se faz check out de algo onde já se aplicou o check in.
O check out só se aplica quando você pretende alterar algo no projeto.
Já encontrei usuários que passaram por algumas dificuldades iniciais na utilização do SCM. Eu pessoalmente recomendo a sua utilização em trabalho de equipe e até mesmo com um único desenvolvedor para backup, controle de versões e roolback.
1) O primeiro passo é instalar o SCM no servidor;
2) A seguir você adiciona pela primeira vez o seu projeto local (o que está no seu pc) ao SCM. Veja "Adding a local project into the Source Code Manager" em
http://doc.windev.com/en-US/?2038002&productversion=XXA150056M3) Acredito que você tenha executado corretamente estes passos;
4) O problema que mais vez ocorre é trabalhar com o projeto depois deste ter sido integrado no SCM;
5) Quem ainda não o tem no pc deve obter uma réplica do que está no SCM para instalação local. Veja "Working on a project found in the Source Code Manager" em
http://doc.windev.com/en-US/?2038004;6) A partir desse momento, todos os usuários devem abrir o projeto local e nunca a partir do SCM.
Cumprimentos,
JJM