Se for um servidor web com dominio, sugiro você usar o deploy via ftp, é facil e muito rapido.
Importante configurar corretamente as permissões, conforme o help doc.pcsoft.fr
Faça um teste.
Se for um localhost eu nunca precisei usar. Seria interessante você gerar um instalador de um site exemplo, para ver se o erro nao é no projeto.
Veja tambem se as permissoes às pastas estão configuradas corretamente e se enviou todos os arquivos necessarios.
Outra coisa a ser vista é se o site esta sendo instalado dentro da pasta "localhost", ou num nivel abaixo, isto tambem pode causar problemas.
Este inicio é sempre a pior parte, passando desta etapa, você nao terá mais problemas.
Para desenvolver na minha maquina eu uso o WAMP é mais facil do que o IIS.
Caso nao dê nada certo, experimente usa-lo no seu server localhost.
